مدير المركزهو الباحث الرئيس للمشاريع المكونة للكيان ويكون له الاختصاصات التالية في حدود القوانين واللوائح المنظمة لذلك :

1. الإشراف على سير العمل بالمركز فنياً وإدارياً .
2. متابعة احتياجات المركز من مذيبات ومواد كيميائية والغازات المسالة لزوم تشغيل المركز .
3. متابعة الصيانة الدورية لتشغيل الأجهزة علي الوجه الاكمل .
4. الإشراف على إعداد مشروع الموازنة السنوية للوحدة تمهيداً للعرض على الجهات المختصة  .
5. اقتراح أسعار الخدمات والاستشارات التي تقدمها المركز للغير وعرضها على مجلس الإدارة للموافقة.
6. اقتراح صرف المكافآت والحوافزلمجلس الإدارة والعاملين بالمركز وعرضهاعلى مجلس الإدارة للموافقة.
7. إعداد التقارير الدورية التى تقدم عن نشاط المركز .
8. دراسة المشاريع المقدمة للوحدة قبل عرضها على مجلس الإدارة.
9. الإشراف على إنشاء وتحديث قواعد البيانات اللازمة لعمل المركز .
10. اقتراح الاستعانة بالعمالة المؤقتة والخبراءالوطنيين للعمل بالمركز وعرضها على مجلس الإدارة للموافقة
11. الموافقة على مستندات الصرف إدارياً .
12. ما يفوض فيه من اختصاصات أخرى من رئيس مجلس الإدارة .
13. يجوز لمدير المركز الاستعانة بالمتخصصين .